Es titulado en Dirección de Orquesta, Dirección de Coros, Clarinete, Flauta Barroca, Piano, Solfeo y Teoría de la Música, Transposición y Acompañamiento, Armonía, Contrapunto, Composición e Instrumentación. Es discípulo del insigne maestro Enrique García Asensio.
Ha ganado numerosos e importantes premios, entre los que caben destacar los correspondientes al concurso de Dirección de Coros convocado por el Conservatorio Superior de Música “Joaquín Rodrigo” de València (1992); el concurso de Dirección de Orquesta convocado por el Real Conservatorio Superior de Música de Madrid (1995); el primer premio y mención de honor, en la máxima categoría, del Certamen Internacional “Ciudad de València” (1999); así como de los concursos nacionales de composición “Ciudad de Orihuela” (2004); “Maestro Turrillas” del Ayuntamiento de Pamplona (2007); y “Maestro Francisco García Muñoz” del Ayuntamiento de Soria (2008).
Realiza grabaciones para los sellos discográficos: RTVE-Música, RNE-Radio Clásica, Nuestras Bandas de Música, …; y ponencias y cursos para el Ministerio de Educación en el campo docente.
Pertenece a la Muy Ilustre Academia de la Música Valenciana, habiendo sido vocal de su Junta de Gobierno y del comité organizador del Certamen Internacional de Bandas de Música “Ciudad de Valencia”. Es miembro de la Sociedad General de Autores y Editores y de la Asociación de Intérpretes y Ejecutantes. Cuenta con más de tres centenares de obras registradas y otros tantos fonogramas y videogramas. Sus instrumentaciones y transcripciones para banda, tanto de música lírica como del repertorio sinfónico, son referentes en la actualidad para las bandas sinfónicas.
En el ámbito docente, Fernando Bonete obtuvo plaza de profesor de Armonía y Melodía Acompañada por oposición libre del Conservatorio de la Diputación de Zamora; y pertenece, por concurso-oposición, al Cuerpo de Profesores de Enseñanza Secundaria en la especialidad de Música, y al Cuerpo de Profesores de Música y Artes Escénicas en la especialidad de Coro y Orquesta.
Es invitado a dirigir las agrupaciones sinfónicas más importantes del estado: Alicante, Almería, Barcelona, Bilbao, Castellón, La Coruña, Madrid, Melilla, Santiago de Compostela, Sevilla, Tenerife, València…, así como jurado en los más relevantes certámenes nacionales e internacionales de composición e interpretación bandística.
Fue Director-Jefe del Servicio Municipal de Música y de la Banda Sinfónica Municipal del Ayuntamiento de Albacete desde 1999 hasta 2012, habiéndose conseguido bajo su mandato la completa profesionalización de la misma; así como de la Banda Municipal de València de 2012 a 2018.